Con el siguiente código nos aseguramos de cerrar un PopUp de Elementor mediante Javascript, en este caso concreto cerrará el PopUp cuando el usuario redimensione la ventana del navegador.
HTML
<script type="text/javascript">
window.addEventListener('resize', function(event) {
//271 es el id del popup de elementor
elementorFrontend.documentsManager.documents[271].getModal().hide();
}, true);
</script>